Efter att den amerikanske forskaren Eric S. Lander formellt föreslog singelnukleotidpolymorfism (SNP) som tredje generationens molekylära markör 1996, har SNP använts i stor utsträckning i analys av ekonomiska egenskapersassociationer, konstruktion av biologiska genetiska länkkartor och screening av mänskliga patogener., Sjukdomsriskdiagnos och förutsägelse, individualiserad läkemedelsscreening och andra biologiska och medicinska forskningsfält.Inom området för förädling av kontantgrödor kan detektering av SNP realisera tidigt urval av nödvändiga egenskaper.Detta urval har egenskaperna för hög noggrannhet och kan effektivt undvika interferens av morfologi och miljöfaktorer, vilket avsevärt förkortar förädlingsprocessen.Därför spelar SNP en enorm roll inom grundforskningsområdet.

Single Nucleotide Polymorphism (Single Nucleotide Polymorphism, SNP) hänvisar till fenomenet att det finns enstaka nukleotidskillnader i samma position i DNA-sekvensen hos individer av samma eller olika arter.Infogning, radering, konvertering och inversion av en enda bas kan alla orsaka denna skillnad.Tidigare var definitionen av SNP annorlunda än den för mutation.Ett variantlokus kräver att frekvensen av en av allelerna i populationen är större än 1 % för att kunna definieras som ett SNP-lokus.Men med expansionen av moderna biologiska teorier och tillämpningen av teknologi är allelfrekvens inte längre ett nödvändigt villkor för att begränsa definitionen av SNP.Enligt de enskilda nukleotidvariationsdata som ingår i databasen Single Nucleotide Polymorphisms (dbSNP) under National Center for Biotechnology Information (NCBI), ingår också lågfrekvent infogning/deletion, mikrosatellitvariation etc.

I människokroppen är frekvensen av SNP 0,1%.Med andra ord finns det i genomsnitt en SNP-plats per 1000 baspar.Även om frekvensen av förekomst är relativt hög, kan inte alla SNP-platser vara kandidatmarkörer relaterade till egenskaper.Detta är främst relaterat till platsen där SNP uppträder.

Teoretiskt kan SNP förekomma var som helst i genomsekvensen.SNP som förekommer i den kodande regionen kan producera synonyma mutationer och icke-synonyma mutationer, det vill säga att aminosyran ändras eller inte ändras före och efter mutationen.Den förändrade aminosyran gör vanligtvis att peptidkedjan förlorar sin ursprungliga funktion (missense-mutation), och kan också orsaka translationsaborter (nonsensmutation).SNP som förekommer i icke-kodande regioner och intergena regioner kan påverka mRNA-splitsning, icke-kodande RNA-sekvenssammansättning och bindningseffektiviteten för transkriptionsfaktorer och DNA.Det specifika förhållandet visas i figuren:

SNP-typer:

Flera vanliga SNP-typningsmetoder och deras jämförelse

Enligt olika principer är vanliga SNP-detektionsmetoder indelade i följande kategorier:

Klassificeringsjämförelse av detektionsmetoder

Notera: Listade i tabellen används för närvarande vanligare SNP-detektionsmetoder, andra detektionsmetoder som specifik platshybridisering (ASH), specific site primer extension (ASPE), single base extension (SBCE), specific site cutting (ASC), genchipsteknologi, masspektrometriteknik, etc. har inte klassificerats och jämförts.

Kostnaden och tiden för nukleinsyrarening i ovanstående flera vanliga SNP-detektionsmetoder är oundvikliga.Däremot kan relaterade kit baserade på Foregenes direkta PCR-teknologi direkt utföra PCR- eller qPCR-amplifiering på orenade prover, vilket ger oöverträffad bekvämlighet för SNP-detektion.

Foregenes produkter i direkt PCR-serien utelämnar helt enkelt provreningssteg, vilket avsevärt minskar tiden och kostnaden som krävs för att förbereda mallar.Det unika Taq-polymeraset har utmärkt amplifieringsförmåga och kan tolerera en mängd olika inhibitorer från komplexa amplifieringsmiljöer.Dessa egenskaper ger en teknisk garanti för att erhålla specifika produkter med hög avkastning. Foregene Direct PCR/qPCR-kit för olika provtyper, såsom: djurvävnader (råttsvans, zebrafisk, etc.), växtblad, frön (inklusive polysackarider och polyfenolprover), etc.