Den 14 december 2020 rapporterade Storbritannienen SARS-CoV-2 variant av oro (VOC), härstamning B.1.1.7,även kallad VOC 202012/01 eller 20I/501Y.V1.* DenB.1.1.7-varianten beräknas ha dykt upp i september2020 och har snabbt blivit den dominerande cirkulerandeSARS-CoV-2-variant i England (1).B.1.1.7 har varitupptäckts i över 30 länder, inklusive USA.Somav den 13 januari 2021 har cirka 76 fall av B.1.1.7upptäckts i 12 amerikanska delstater.Flera bevislinjerindikera att B.1.1.7 sänds mer effektivt än vad som ärandra SARS-CoV-2-varianter (1–3).Den modellerade banan fördenna variant i USA uppvisar snabb tillväxt i början av 2021,blir den dominerande varianten i mars.ÖkadeSARS-CoV-2-överföring kan hota ansträngd sjukvårdresurser, kräver ett utökat och mer rigoröst genomförandeav folkhälsostrategier (4), och öka andelen avbefolkningsimmunitet som krävs för pandemikontroll.Taråtgärder för att minska överföringen nu kan minska potentialeneffekterna av B.1.1.7 och tillåta kritisk tid för att öka vaccinationentäckning.Tillsammans förbättrad genomisk övervakningkombinerat med fortsatt efterlevnad av effektiv offentlighethälsoåtgärder, inklusive vaccination, fysisk distansering,användning av masker, handhygien och isolering och karantän, kommervara avgörande för att begränsa spridningen av SARS-CoV-2, virusetsom orsakar coronavirus sjukdom 2019 (COVID-19).Strategisktestning av personer utan symtom men med högre risk förinfektion, såsom de som exponerats för SARS-CoV-2 eller som harfrekvent oundviklig kontakt med allmänheten, ger en annanmöjlighet att begränsa pågående spridning.

Global genomisk övervakning och snabb delning med öppen källkodning av virala genomsekvenser har underlättat nästan realtidupptäckt, jämförelse och spårning av utvecklande SARS-CoV-2varianter som kan informera folkhälsoinsatser för att kontrollerapandemisk.Medan vissa mutationer i det virala genometkomma upp och sedan dra sig tillbaka, andra kan ge en selektiv fördelta till varianten, inklusive förbättrad överföringsförmåga, så atten sådan variant kan snabbt dominera andra cirkulerande varianter.

Tidigt i pandemin, varianter av SARS-CoV-2 innehållandeD614G-mutationen i spike (S)-proteinet som ökarreceptorbindningsaviditet blev snabbt dominerande hos mångageografiska regioner (5,6).Under senhösten 2020 rapporterade flera länder att de upptäcktSARS-CoV-2-varianter som sprider sig mer effektivt.Dessutomtill B.1.1.7-varianten inkluderar anmärkningsvärda varianter B.1.351härstamning som först upptäcktes i Sydafrika och den nyligen identifieradeB.1.1.28 subclade (döpt om"P.1”) upptäckts hos fyra resenärerfrån Brasilien under rutinmässig screening på Haneda (Tokyo)flygplats.§ Dessa varianter bär en konstellation av genetiska mutationer, inklusive i den S-proteinreceptorbindande domänen,som är avgörande för att binda till värdcellens angiotensin-omvandling av enzym-2 (ACE-2) receptor för att underlätta virusinträde.Bevis tyder på att andra mutationer finns i dessavarianter kan ge inte bara ökad överföringsförmåga utankan också påverka prestandan för viss diagnostisk realtidomvänd transkription–polymeraskedjereaktion (RT-PCR)analyser¶ och minska känsligheten för neutraliserande antikroppar(2,3,5–10).En färsk fallrapport dokumenterade det första fallet avSARS-CoV-2-återinfektion i Brasilien med en SARS-CoV-2-variantsom innehöll E484K-mutationen,** som har visatsför att minska neutralisering av konvalescenta sera och monoklonalaantikroppar (9,10).

Denna rapport fokuserar på framväxten av B.1.1.7-varianteni USA.Från och med den 12 januari 2021, varkenB.1.351 eller P.1-varianterna har upptäckts iFörenta staterna.För information om framväxande SARS-CoV-2varianter av oro, CDC har en webbsida dedikerad tilltillhandahålla information om nya SARS-CoV-2-varianter.††

 B.1.1.7 härstamning (20I/501Y.V1)

B.1.1.7-varianten bär på en mutation i S-proteinet(N501Y) som påverkar konformationen av receptorbindningdomän.Denna variant har 13 andra B.1.1.7 härstamningsdefinierande mutationer (tabell), av vilka flera finns i S-proteinet,inklusive en radering vid positionerna 69 och 70 (del69–70) detutvecklats spontant i andra SARS-CoV-2-varianter och ärhypotesen ökar överföringsförmågan (2,7).Borttagningenvid positionerna 69 och 70 orsakar S-genens målfel (SGTF)i minst en RT-PCR–baserad diagnostisk analys (dvs. medThermoFisher Taq Path COVID-19-analys, B.1.1.7 varimyra och andra varianter med del69–70 ger ett negativtresultat för S-genmål och ett positivt resultat för de andra tvåmål);SGTF har fungerat som ombud i Storbritannienför att identifiera B.1.1.7 fall (1).Flera bevis visar att B.1.1.7 är meröverförs effektivt jämfört med andra SARS-CoV-2varianter som cirkulerar i Storbritannien.Storbritanniens regioner meden högre andel B.1.1.7-sekvenser hade snabbare epidemitillväxt än vad andra områden gjorde, ökade diagnoserna med SGTFsnabbare än icke-SGTF-diagnoser inom samma områden, och ahögre andel kontakter infekterades av indexpatientermed B.1.1.7-infektioner än av indexpatienter infekterade medandra varianter (1,3).Variant B.1.1.7 har potential att öka den amerikanska pannandemisk bana under de kommande månaderna.För att illustrera denna effekt,en enkel kompartmentmodell med två varianter utvecklades.Den nuvarande amerikanska prevalensen av B.1.1.7 bland alla cirkulerandevirus är okänt men tros vara <0,5 % baserat påbegränsat antal upptäckta fall och SGTF-data (8).Förmodellen inkluderade initiala antaganden en B.1.1.7-prevalenspå 0,5 % bland alla infektioner, SARS-CoV-2-immunitet fråntidigare infektion på 10 %–30 %, en tidsvarierande reproduktionantal (R t ) av 1,1 (minskad men ökande överföring)eller 0,9 (minskande överföring) för nuvarande varianter, och rapporteras incidens av 60 fall per 100 000 personer per dag1 januari 2021. Dessa antaganden representerar inte exaktnågon enskild plats i USA, utan snarare indikera en generalisering avvanliga förhållanden i landet.Förändringen i R t övertid till följd av förvärvad immunitet och ökande prevaLens av B.1.1.7, modellerades, med B.1.1.7 R t antagenatt vara en konstant 1,5 gånger Rt för nuvarande varianter, baserat påinitiala uppskattningar från Storbritannien (1,3).Därefter modellerades den potentiella effekten av vaccinationförutsatt att 1 miljon vaccindoser administrerades perdag som börjar 1 januari 2021, och att 95 % immunitetuppnåddes 14 dagar efter mottagandet av 2 doser.Specifikt,immunitet mot infektion med antingen nuvarande varianter ellerB.1.1.7 variant antogs, även om effektiviteten ochskyddets varaktighet mot infektion är fortfarande osäker,eftersom dessa inte var det primära effektmåttet i kliniska prövningarför initiala vacciner.I denna modell är B.1.1.7-prevalensen initialt låg, men ändå pgadet är mer överförbart än nuvarande varianter, visar detsnabb tillväxt i början av 2021 och blev den dominerande variantenmyra i mars (Figur 1).Oavsett om överföring av strömvarianter ökar (initial Rt = 1,1) eller minskar långsamt(initial Rt = 0,9) i januari driver B.1.1.7 en väsentlig förändringi överföringsbanan och en ny fas av exponentielltillväxt.Med vaccination som skyddar mot infektiontidiga epidemiska banor förändras inte och B.1.1.7 spridsfortfarande förekommer (Figur 2).Men efter att B.1.1.7 blir dendominerande variant, reducerades dess transmission avsevärt.Effekten av vaccination på att minska överföringen i närområdetsikt var störst i det scenario där överföring varredan minskande (initial Rt = 0,9) (Figur 2).Tidiga ansträngningar attkan begränsa spridningen av B.1.1.7-varianten, som universal ochökad efterlevnad av strategier för att minska folkhälsan,kommer att ge mer tid för pågående vaccination för att uppnå högreimmunitet på befolkningsnivå.

Diskussion

För närvarande finns det ingen känd skillnad i kliniska resultatassocierad med de beskrivna SARS-CoV-2-varianterna;dock,en högre överföringshastighet kommer att leda till att fler fall ökarantalet personer totalt sett som behöver klinisk vård, exacersläpa bördan på ett redan ansträngt hälso- och sjukvårdssystem,och resulterar i fler dödsfall.Fortsatt genomisk övervakningatt identifiera B.1.1.7 fall, samt uppkomsten av andravarianter av oro i USA, är viktigt förCovid-19 folkhälsoåtgärder.Medan SGTF-resultatenkan hjälpa till att identifiera potentiella B.1.1.7-fall som kan bekräftasgenom att sekvensera, identifiera prioriterade varianter som inte uppvisarSGTF förlitar sig uteslutande på sekvensbaserad övervakning.